Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CckarO08786 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckarO08786 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms