Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna5O08543 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efna5O08543 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms