Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3239L7N2D9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3239L7N2D9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms