Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8888J3QPX5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms