Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccer2J3QPU5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer2J3QPU5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms