Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm2035J3QP87 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm2035J3QP87 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm2035J3QP87 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm2035J3QP87 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm2035J3QP87 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm2035J3QP87 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm2035J3QP87 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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