Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa8J3QNX5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa8J3QNX5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms