Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c2J3QNM1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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