Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21788J3QNH3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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