Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3415J3QMS8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3415J3QMS8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms