Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3336J3QMQ6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3336J3QMQ6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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