Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21818J3KMS6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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