Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pot1bH7BX60 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pot1bH7BX60 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pot1bH7BX60 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms