Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf4bG5E8Z2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
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Taf4bG5E8Z2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Taf4bG5E8Z2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Taf4bG5E8Z2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Taf4bG5E8Z2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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