Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp6G5E8P0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp6G5E8P0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms