Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HrcG5E8J6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HrcG5E8J6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HrcG5E8J6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms