Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf148G3X9R7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms