Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmgxb3G3X9M3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgxb3G3X9M3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms