Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Speer4cG3UXD1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Speer4cG3UXD1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms