Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r167G3UW71 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r167G3UW71 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms