Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp72F8VQC1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp72F8VQC1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms