Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ScaperF8VQ70 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ScaperF8VQ70 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms