Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms