Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LctF8VPT3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LctF8VPT3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms