Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8005F6YKY3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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