Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zfp988F6VKC7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Zfp988F6VKC7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Zfp988F6VKC7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Zfp988F6VKC7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp988F6VKC7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Zfp988F6VKC7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Zfp988F6VKC7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Zfp988F6VKC7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Zfp988F6VKC7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Zfp988F6VKC7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp988F6VKC7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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