Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5861F6VCN9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms