Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21977F6U3N7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms