Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28374F6SG70 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28374F6SG70 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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