Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syngap1F6SEU4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms