Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC067074F6RXI4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC067074F6RXI4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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