Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Urb2E9Q7L1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Urb2E9Q7L1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms