Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtproE9Q612 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtproE9Q612 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms