Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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FancfE9Q5Z5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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FancfE9Q5Z5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FancfE9Q5Z5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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