Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BC005561E9Q5E2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BC005561E9Q5E2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms