Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17175E9Q528 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17175E9Q528 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms