Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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