Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3020E9Q3J7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3020E9Q3J7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms