Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms