Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hectd4E9Q2E4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms