Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ccdc171E9Q1U1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc171E9Q1U1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ccdc171E9Q1U1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Ccdc171E9Q1U1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Ccdc171E9Q1U1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Ccdc171E9Q1U1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc171E9Q1U1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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