Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lrp3E9Q1T6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lrp3E9Q1T6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrp3E9Q1T6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms