Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3250E9Q1M3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3250E9Q1M3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms