Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3893E9Q1I1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3893E9Q1I1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms