Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt78E9Q0F0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt78E9Q0F0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms