Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3095E9Q058 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3095E9Q058 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms