Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fndc1E9Q043 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc1E9Q043 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms