Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20425E9Q035 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms