Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rsph10bE9PYQ0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms