Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54bE9PXC0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Srp54bE9PXC0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms